Антигенные кластеры трансмембранных и капсидных белков вируса артрита-энцефалита коз и их биоинформационный анализ

Abstract

Методами биоинформационного анализа были исследованы антигенные детерминанты белков вируса артрита-энцефалита коз. В результате были обнаружены две специфические указанному вирусу группы: эпитопы белков, кодируемых геном env, и эпитопы белков, кодируемых геном gag. Было установлено, что наибольшую диагностическую ценность представили два эпитопа трансмембранного белка ТМ gp38 и один - капсидного белка р25. Это выражается в высокой вероятности, достаточнной степени и наибольшем количестве совпадений их аминокислотных последовательностей как с белками большинства штаммов вируса артрита-энцефалита коз, так и общегрупповых лентивирусов мелкого рогатого скота.