dc.contributor.author |
Аюпов Рустам Хасанович |
|
dc.contributor.author |
Акберова Наталья Ивановна |
|
dc.contributor.author |
Тарасов Денис Станиславович |
|
dc.date.accessioned |
2015-07-03T11:55:52Z |
|
dc.date.available |
2015-07-03T11:55:52Z |
|
dc.date.issued |
2012 |
|
dc.identifier.issn |
1815-6169 |
|
dc.identifier.uri |
http://dspace.kpfu.ru/xmlui/handle/net/27009 |
|
dc.description.abstract |
Выявление механизма взаимодействия ферментов с лигандами в активном центре необходимо для эффективного поиска новых лекарственных средств и целенаправленного изменения существующих. В настоящей работе было проведено компьютерное моделирование реакции между производным пиридоксина и каталитической триадой активного центра ацетилхолинэстеразы для выяснения роли сайтов активного центра при взаимодействии с ингибитором. Изучено влияние на реакцию взаимодействия следующих сайтов активного центра: периферийный анионный сайт, анионный сайт, оксианионная дыра, омега-петля, ацильный карман. Моделирование проводилось в программе PC GAMESS методом АМ1, в качестве координаты реакции было выбрано расстояние между углеродом карбамоилированного фрагмента производного пиридоксина и кислородом гидроксильной группы аминокислотного остатка серина Ser203 каталитической триады, изменение координат происходило с шагом 0.2 Å. Наибольшее и наименьшее значения энергетических пиков равны 54.24 и 45.52 ккаль/моль соответственно. При моделировании контрольной реакции каталитической триады с производным пиридоксина без окружения энергетический пик составил 49.12 ккаль/моль. Полученные значения энергетических барьеров велики, что, возможно, связано с тем, что при моделировании реакции учитывалось влияние отдельных частей активного центра, а не всего фермента. |
|
dc.publisher |
Казанский (Приволжский) федеральный университет |
|
dc.relation.ispartofseries |
Ученые записки КФУ. Естественные науки |
|
dc.subject.other |
молекулярное моделирование |
|
dc.subject.other |
ацетилхолинэстераза (АХЭ) |
|
dc.subject.other |
производные пиридоксина |
|
dc.subject.other |
ингибиторы АХЭ |
|
dc.title |
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПРОИЗВОДНОГО ПИРИДОКСИНА
С АКТИВНЫМ ЦЕНТРОМ АЦЕТИЛХОЛИНЭСТЕРАЗЫ
// Ученые записки КФУ. Естественные науки 2012 N2 |
|
dc.type |
Article |
|
dc.relation.ispartofseries-issue |
2 |
|
dc.collection |
Публикации сотрудников КФУ |
|
dc.relation.startpage |
234 |
|
dc.source.id |
ELIB18156169-2012-2-24 |
|