ПРОЦЕССЫ КОММУНИКАЦИИ ЭВОЛЮЦИОНИРУЮЩИХ БАКТЕРИАЛЬНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ: IN SILICO ИССЛЕДОВАНИЕ НА ПЛАТФОРМЕ CAMSOL MULTIPHYSICS

Abstract

Представлены результаты компьютерной реализации 2D дифференциальной модели процесса бактериальной коммуникации. Модель формализована в виде начально-краевой задачи для системы полулинейных уравнений с частными производными. Задача решена методом конечных элементов с использованием платформы COMSOL MultIphysics. Представлены результаты вычислительных экспериментов на примере бактериального вида P. putida. Модель позволяет прогнозировать концентрационные характеристики химических соединений, определяющих уровень межклеточной коммуникации микробного сообщества.

The results of a computer implementation of a 2D differential model of bacterial communication process are presented. The model is formalized as an initial-boundary value problem for a system of semilinear partial differential equations. The problem was solved by the finite element method using the COMSOL MultIphysics platform. The results of computational experiments are presented on the example of the P. putida bacterial species to predict the concentration characteristics of chemical compounds that specify the cell-to-cell communication of the microbial community.