Электронный архив

Classical and quantum algorithms for assembling a text from a dictionary

Показать сокращенную информацию

dc.contributor.author Khadiev K.
dc.contributor.author Remidovskii V.
dc.date.accessioned 2022-02-09T20:37:30Z
dc.date.available 2022-02-09T20:37:30Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.issn 1561-4085
dc.identifier.uri https://dspace.kpfu.ru/xmlui/handle/net/169448
dc.description.abstract We study algorithms for solving the problem of assembling a text (long string) from a dictionary (a sequence of small strings). The problem has an application in bioinformatics and has a connection with the sequence assembly method for reconstructing a long deoxyribonucleic-acid (DNA) sequence from small fragments. The problem is assembling a string t of length n from strings s1, …, sm. Firstly, we provide a classical (randomized) algorithm with running timeÕ(nL0.5 + L) where L is the sum of lengths of s1, …, sm. Secondly, we provide a quantum algorithm with running timeÕ(nL0.25 +√mL). Thirdly, we show the lower bound for a classical (randomized or deterministic) algorithm that is Ω(n+L). So, we obtain the quadratic quantum speed-up with respect to the parameter L; and our quantum algorithm have smaller running time comparing to any classical (randomized or deterministic) algorithm in the case of non-constant length of strings in the dictionary.
dc.relation.ispartofseries Nonlinear Phenomena in Complex Systems
dc.subject DNA constructing
dc.subject Quantum algorithm
dc.subject Quantum computation
dc.subject Sequence assembly
dc.subject String constructing
dc.title Classical and quantum algorithms for assembling a text from a dictionary
dc.type Article
dc.relation.ispartofseries-issue 3
dc.relation.ispartofseries-volume 24
dc.collection Публикации сотрудников КФУ
dc.relation.startpage 207
dc.source.id SCOPUS15614085-2021-24-3-SID85120069209


Файлы в этом документе

Данный элемент включен в следующие коллекции

  • Публикации сотрудников КФУ Scopus [24551]
    Коллекция содержит публикации сотрудников Казанского федерального (до 2010 года Казанского государственного) университета, проиндексированные в БД Scopus, начиная с 1970г.

Показать сокращенную информацию

Поиск в электронном архиве


Расширенный поиск

Просмотр

Моя учетная запись

Статистика