БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ ПОИСК НОВЫХ МЕХАНИЗМОВ ЦИТОТОКСИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ БИНАЗЫ // Ученые записки КФУ. Естественные науки 2013 том155 N3

Abstract

Рибонуклеазы, в том числе экзорибонуклеаза Bacillus intermedius (биназа), рассматриваются в качестве потенциальных противоопухолевых агентов ввиду своей избирательной цитотоксичности по отношению к раковым клеткам. Механизм их цитотоксического действия до конца не установлен. Некоторые экспериментальные данные противоречат общепринятой концепции, в соответствии с которой в основе действия РНКаз на опухолевые клетки лежит деградация некоторых типов клеточной РНК. Настоящая работа посвящена поиску в аминокислотной последовательности биназы участков, сходных с консервативными участками протеинкиназ различной специфичности. Обнаружение у биназы второй, протеинкиназной активности (аналогично бифункциональности триптофанил-тРНКазы человека и некоторых дегидрогеназ) могло бы объяснить её комплексное действие на опухолевые клетки. В молекуле биназы нами обнаружены последовательности, аналогичные консервативным участкам, связывающим и ориентирующим молекулы АТФ в серин/треониновых протеинкиназах. Однако взаимное расположение данных участков в третичной структуре биназы не аналогично таковому в молекулах протеинкиназ.