Kazan Federal University Digital Repository

ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПРОИЗВОДНОГО ПИРИДОКСИНА С АКТИВНЫМ ЦЕНТРОМ АЦЕТИЛХОЛИНЭСТЕРАЗЫ // Ученые записки КФУ. Естественные науки 2012 N2

Show simple item record

dc.contributor.author Аюпов Рустам Хасанович
dc.contributor.author Акберова Наталья Ивановна
dc.contributor.author Тарасов Денис Станиславович
dc.date.accessioned 2015-07-03T11:55:52Z
dc.date.available 2015-07-03T11:55:52Z
dc.date.issued 2012
dc.identifier.issn 1815-6169
dc.identifier.uri http://dspace.kpfu.ru/xmlui/handle/net/27009
dc.description.abstract Выявление механизма взаимодействия ферментов с лигандами в активном центре необходимо для эффективного поиска новых лекарственных средств и целенаправленного изменения существующих. В настоящей работе было проведено компьютерное моделирование реакции между производным пиридоксина и каталитической триадой активного центра ацетилхолинэстеразы для выяснения роли сайтов активного центра при взаимодействии с ингибитором. Изучено влияние на реакцию взаимодействия следующих сайтов активного центра: периферийный анионный сайт, анионный сайт, оксианионная дыра, омега-петля, ацильный карман. Моделирование проводилось в программе PC GAMESS методом АМ1, в качестве координаты реакции было выбрано расстояние между углеродом карбамоилированного фрагмента производного пиридоксина и кислородом гидроксильной группы аминокислотного остатка серина Ser203 каталитической триады, изменение координат происходило с шагом 0.2 Å. Наибольшее и наименьшее значения энергетических пиков равны 54.24 и 45.52 ккаль/моль соответственно. При моделировании контрольной реакции каталитической триады с производным пиридоксина без окружения энергетический пик составил 49.12 ккаль/моль. Полученные значения энергетических барьеров велики, что, возможно, связано с тем, что при моделировании реакции учитывалось влияние отдельных частей активного центра, а не всего фермента.
dc.publisher Казанский (Приволжский) федеральный университет
dc.relation.ispartofseries Ученые записки КФУ. Естественные науки
dc.subject.other молекулярное моделирование
dc.subject.other ацетилхолинэстераза (АХЭ)
dc.subject.other производные пиридоксина
dc.subject.other ингибиторы АХЭ
dc.title ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ПРОИЗВОДНОГО ПИРИДОКСИНА С АКТИВНЫМ ЦЕНТРОМ АЦЕТИЛХОЛИНЭСТЕРАЗЫ // Ученые записки КФУ. Естественные науки 2012 N2
dc.type Article
dc.relation.ispartofseries-issue 2
dc.collection Публикации сотрудников КФУ
dc.relation.startpage 234
dc.source.id ELIB18156169-2012-2-24


Files in this item

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Search DSpace


Advanced Search

Browse

My Account

Statistics